四月，陕西起义军首领王佐桂攻打耀州，粮道参议洪承畴率兵抵抗，大破反贼。
五月，礼部尚书徐光启上书，请参用西法，使用西洋年历，朱由检允，自此大明实施新历。
六月，督师蓟辽的袁崇焕使用尚方宝剑，擅自斩杀毛岛总兵大将毛文龙，朝野轰动。
十月，后金皇太极兵分三路，直逼关内，蓟州被围，京师戒严。
十一月，山海关总兵赵率教战死，建奴攻破山海关滚滚而来，进犯京城，朝野震惊，史称己巳之变。
十二月，各地勤王军纷纷抵达，意图解除京城之危，大名知府卢象升率一万天雄军千里奔驰，自此名震天下。
同月，朱由检将袁崇焕下狱，激起下属祖大寿强烈不满，一度出走关外投靠后金，幸得孙承宗召回。
崇祯三年。
后金皇太极依旧攻势汹汹，一路势如破竹，
五月，朱由检命督师孙承宗、总兵马世龙、祖大寿联手反击，连胜数阵收复失地，后金受阻，暂返辽东。
六月，延绥巡抚洪承畴，率兵击败起义军首领王嘉允，追击途中，再次击败起义军首领张献忠，大胜而归。
八月，朱由检以谋逆大罪，将袁崇焕施以凌迟之刑，兄弟妻子流三千里，籍其家。
京城民众欢呼雀跃，天下百姓呜呼哀哉。
崇祯四年。
正月，后金皇太极吸取教训，铸造红衣大炮，炮身铭刻【天佑助威大将军】，自此建奴拥有火器，开始利用其攻城拔寨。
三月，福建农民起义军揭竿而起，势如破竹，沿途未遇任何抵抗，朱由检忙派兵剿之。